Les peptides pénétrants cellulaires sont de petits peptides qui peuvent facilement pénétrer la membrane cellulaire. Cette classe de molécules, en particulier les CPP avec des fonctions de ciblage, est prometteuse d'une administration efficace de médicaments aux cellules cibles.
Par conséquent, la recherche à ce sujet a une certaine signification biomédicale. Dans cette étude, les CPP avec différentes activités transmembranaires ont été étudiés au niveau de la séquence, essayant de découvrir les facteurs affectant l'activité transmembranaire des CPP, les différences de séquence entre les CPP avec différentes activités et les non-CPP, et introduire une méthode pour analyser les séquences biologiques.
Les séquences CPPS et non CPPS ont été obtenues à partir de la base de données CPPSite et des différentes littératures, et des peptides transmembranaires (HCPPS, MCPPS, LCPP) avec une activité transmembranaire élevée, moyenne et faible ont été extraits des séquences CPPS pour construire des ensembles de données. Sur la base de ces ensembles de données, les études suivantes ont été menées:
1, l'acide aminé et la composition de la structure secondaire de différents CPP actifs et non CPP ont été analysés par ANOVA. Il a été constaté que les interactions électrostatiques et hydrophobes des acides aminés jouaient un rôle important dans l'activité transmembranaire des CPP, et la structure hélicoïdale et le bobinage aléatoire ont également affecté l'activité transmembranaire des CPP.
2. Les propriétés physiques et chimiques et les longueurs des CPP avec différentes activités ont été affichées sur le plan bidimensionnel. Il a été constaté que les CPP et les non-CPP avec différentes activités pouvaient être regroupés sous certaines propriétés spéciales, et les HCPP, les MCPP, les LCPP et les non-CPP ont été divisés en trois grappes, montrant leurs différences;
3. Dans cet article, le concept de centroïde physique et chimique de la séquence biologique est introduit, et les résidus composant la séquence sont considérés comme des points de particules, et la séquence est résumée comme un système de particules pour la recherche. Cette méthode a été appliquée à l'analyse des CPP en projetant les CPP avec différentes activités sur le plan 3D par méthode PCA, et il a été constaté que la plupart des CPP se sont regroupés et certains LCPP se sont regroupés avec les non-CPPS.
Cette étude a des implications pour la conception des CPP et la compréhension des différences dans les séquences des CPP avec différentes activités. De plus, la méthode d'analyse de centroïde physique et chimique des séquences biologiques introduite dans cet article peut également être utilisée pour l'analyse d'autres problèmes biologiques. Dans le même temps, ils peuvent être utilisés comme paramètres d'entrée pour certains problèmes de classification biologique et jouer un rôle dans la reconnaissance des modèles.
Heure du poste: 2025-07-02