Schéma de conception et solution de la chaîne peptidique polypeptidique

I. Résumé
Les peptides sont des macromolécules spéciales telles que leurs séquences sont inhabituelles dans leurs caractéristiques chimiques et physiques. Certains peptides sont difficiles à synthétiser, tandis que d'autres sont relativement faciles à synthétiser mais difficiles à purifier. Le problème pratique est que la plupart des peptides sont légèrement solubles dans des solutions aqueuses, donc dans notre purification, la partie correspondante du peptide hydrophobe doit être dissoute dans des solvants non aqueux, par conséquent, ces solvants ou tampons Aspects de la conception des peptides pour les chercheurs.

Schéma de conception et solution de la chaîne peptidique polypeptidique
Deuxièmement, le bon choix de peptides difficiles synthétiques
1. Longueur totale des séquences régulées à la baisse
Les peptides de moins de 15 résidus sont plus faciles à obtenir car la taille du peptide augmente et la pureté du produit brut diminue. À mesure que la longueur totale de la chaîne peptidique augmente au-delà de 20 résidus, la quantité précise du produit est une préoccupation clé. Dans de nombreuses expériences, il est facile d'obtenir des effets inattendus en abaissant le numéro de résidu inférieur à 20.
2. Diminuez le nombre de résidus hydrophobes
Les peptides avec une grande prédominance de résidus hydrophobes, en particulier dans les résidus de la région 7 à 12, de l'extrémité C-terminale, provoquent généralement des difficultés synthétiques. Ceci est considéré comme une combinaison inadéquate précisément parce qu'une feuille B est obtenue dans la synthèse. "Dans de tels cas, il peut être utile de convertir plus de deux résidus positifs et négatifs, ou de mettre Gly ou Pro dans le peptide pour déverrouiller la composition du peptide."
3. Régulation à la baisse des résidus «difficiles»
«Il y a un certain nombre de Cys, Met, Arg, et essayez des résidus qui ne sont généralement pas facilement synthétisés.» SER sera généralement utilisé comme alternative non oxydante à Cys.
Schéma de conception et solution de la chaîne peptidique polypeptidique

Troisièmement, améliorez le bon choix de soluble dans l'eau
1. Ajustez l'extrémité N ou C
Par rapport aux peptides acides (c'est-à-dire négativement chargés à pH 7), l'acétylation (acétylation N-terminale, le terminus C conservant toujours un groupe carboxyle libre) est particulièrement recommandé pour augmenter la charge négative. Cependant, pour les peptides de base (c'est-à-dire positivement chargés à pH 7), l'amination (groupe amino libre à l'extrémité N-terminale et amination à l'extrémité C) est particulièrement recommandée pour augmenter la charge positive.

2. Raccourcir ou allonger considérablement la séquence

Certaines des séquences contiennent un grand nombre d'acides aminés hydrophobes, tels que TRP, PHE, Val, Ile, Leu, Met, Tyr et Ala, etc. Lorsque ces résidus hydrophobes dépassent 50%, ils ne sont généralement pas faciles à dissoudre. Il peut être utile d'allonger la séquence pour augmenter davantage les pôles positifs et négatifs du peptide. La deuxième option consiste à réguler à la baisse la taille de la chaîne peptidique pour augmenter les pôles positifs et négatifs en régulant à la baisse les résidus hydrophobes. Plus les côtés positifs et négatifs de la chaîne peptidique sont forts, plus il est susceptible de réagir avec l'eau.
3. Mettez un résidu soluble dans l'eau
Pour certaines chaînes peptidiques, la combinaison de certains acides aminés positifs et négatifs peut améliorer la solubilité dans l'eau. Notre entreprise recommande que l'extrémité N-terminale ou le C-terminal des peptides acides soit combinée avec Glu-Glu. L'extrémité N ou C du peptide de base a été donnée puis Lys-lys. Si le groupe chargé ne peut pas être placé, Ser-Gly-Ser peut également être placé dans l'extrémité N ou C. Cependant, cette approche ne fonctionne pas lorsque les côtés de la chaîne peptidique ne peuvent pas être modifiés.