Dans cet article, deux acides aminés basiques, la glycine (Gly) et l'alanine (Ala), sont présentés.Cela est principalement dû au fait qu’ils peuvent agir comme des acides aminés de base et que leur ajouter des groupes peut générer d’autres types d’acides aminés.
La glycine a un goût sucré particulier, c'est pourquoi son nom anglais vient du grec glykys(doux).La traduction chinoise de glycine a non seulement le sens de « doux », mais a également une prononciation similaire, qui peut être qualifiée de modèle de « fidélité, réussite et élégance ».En raison de son goût sucré, la glycine est souvent utilisée comme agent aromatisant dans l’industrie alimentaire pour éliminer l’amertume et augmenter le goût sucré.La chaîne latérale de la glycine est petite avec un seul atome d'hydrogène.Cela le rend différent.C'est un acide aminé basique sans chiralité.
La glycine présente dans les protéines se caractérise par sa petite taille et sa flexibilité.Par exemple, la conformation en hélice à trois brins du collagène est très particulière.Il doit y avoir une glycine pour deux résidus, sinon cela provoquerait trop d'encombrement stérique.De même, la liaison entre deux domaines d’une protéine nécessite souvent la glycine pour assurer une flexibilité conformationnelle.Or, si la glycine est suffisamment souple, sa stabilité est forcément insuffisante.
La glycine est l'un des spoilers lors de la formation de l'hélice α.La raison en est que les chaînes latérales sont trop petites pour stabiliser la conformation.De plus, la glycine est souvent utilisée pour préparer des solutions tampons.Ceux d’entre vous qui pratiquent l’électrophorèse s’en souviennent souvent.
Le nom anglais de l'alanine vient de l'allemand acétaldéhyde, et le nom chinois est plus facile à comprendre car l'alanine contient trois carbones et son nom chimique est alanine.C’est un nom simple, tout comme le caractère de l’acide aminé.La chaîne latérale de l'alanine n'a qu'un seul groupe méthyle et est légèrement plus grande que celle de la glycine.Lorsque j’ai dessiné les formules développées des 18 autres acides aminés, j’ai ajouté des groupes à l’alanine.Dans les protéines, l'alanine est comme une brique, un matériau de construction de base commun qui n'entre en conflit avec personne.
La chaîne latérale de l'alanine est peu encombrée et est située dans l'hélice α, qui est une conformation.Il est également très stable une fois plié en β.En ingénierie des protéines, si vous souhaitez muter un acide aminé sans cible spécifique sur une protéine, vous pouvez généralement le muter en alanine, ce qui n'est pas facile à détruire la conformation globale de la protéine.
Heure de publication : 29 mai 2023